肇庆出入境检验检疫局是国家质量监督检验检疫总局设在广东的分支机构，隶属广东出入境检验检疫局。肇庆局下设4个行政科室、8个业务科室、5个办事处（三榕港办事处、四会马房办事处、高要港办事处、亚洲工业园办事处、火车站办事处）、2个检验检疫科。此外，还下设综合技术中心（实验室）和机关服务中心2个事业单位。 

　　肇庆出入境检验检疫局行使《中华人民共和国进出口商品检验法》、《中华人民共和国进出境动植物检疫法》、《中华人民共和国国境卫生检疫法》和《中华人民共和国食品卫生法》等法律法规赋予职责的行政执法机关，依法履行出入境卫生检疫和动植物检疫，以及进出口商品检验、鉴定、认证和监督管理工作，充分运用行政和技术手段，通过对涉及健康、卫生、安全、环保和反欺诈的检验检疫把关，维护国家主权、经济安全和生态安全，保护出入境人员身体健康。主要职责包括： 

　　1．贯彻执行国家《进出口商品检验法》、《进出境动植物检疫法》、《国境卫生检疫法》、《食品卫生法》及国家相关的政策、法令和上级主管部门制定的工作方针和法规的实施办法。 

　　2．负责对肇庆市的入出境人员、交通工具、货物、行李、邮包、动植物及其产品的检验检疫、监督监测、卫生处理，以及签发各类检验检疫证书。 

　　3．负责对《检验检疫商品目录》内商品和根据国家法律、行政法规规定须经检验检疫机构检验检疫的进出口商品实施法定检验和国内外委托检验的业务。 

　　4．组织和监督管理肇庆市进出口商品的收用货部门、生产、经营和储运部门，以及认可的检验机构、认可检验员的进出口商品检验工作。 

　　5．负责对所辖区内的进出口商品及其生产单位的卫生注册登记、检验认证、颁发质量许可证的考核、初审后报上级审批。对领证的有关单位实行后续的管理工作。 

　　6．负责出口商品普惠制原产地证和一般原产地证的签证工作。对报检员进行培训、发证、年审。 

　　7．组织本局各科室开展科学研究及调查研究工作。负责所辖区内疫情的收集、分析、整理和上报工作。 

　　8．负责管理本局进出口商品的检验签证、统计、计费、收费及财务收支管理的工作。 

　　9．负责对本局工作人员的管理、教育、培训以及内部调整、调配等工作。 

　　10．承办上级主管部门交办的其他工作。 

　　近年来，肇庆出入境检验检疫局在广东出入境检验检疫局的正确领导下和肇庆市委、市政府的支持配合下，坚持用科学发展观统揽工作全局，不断创新检验检疫监管方式和工作模式，开展检验检疫监督管理电子化模式改革，有效促进了肇庆出口企业质量管理水平的提高和检验检疫监督管理工作的有效性；采取一系列强有力的措施不断强化执法把关能力，确保了进出境商品的检验检疫工作质量，有力推动了肇庆经济的持续健康发展。